哥伦比亚大学应用经济学硕士项目开设了10个重点研究方向,分别为分析方法(Analytical Methods)、经济计量方法(Econometric Methods)、货币与金融经济学(Monetary and Financial Economics)、量化金融、风险管理与投资管理(Quantitative Finance, Risk Management, and Investment Management)、劳动经济学与人力资本(Labor Economics and Human Capital)、国际经济学与公共政策(International Economics and Public Policy (IEPP))、发展与增长(Development and Growth)、法律经济学与公共政策(Law and Economics)以及教育经济学(Economics of Education)。不同方向对于学生本科学习的基础要求也有略微的差异。